Ketika iblis yang bisa berubah bentuk dan haus akan daging manusia, yang dikenal sebagai “youma”, tiba di desa Raki, seorang wanita sendirian dengan mata perak masuk ke kota dengan hanya membawa pedang di punggungnya. Dia adalah “Claymore”, makhluk yang diproduksi sebagai setengah manusia dan setengah youma, dengan tujuan untuk memusnahkan monster-monster ini. Setelah keluarga Raki terbunuh, Claymore menyelamatkan nyawanya, tapi dia kemudian diusir dari rumahnya. Karena tidak punya tempat lain untuk pergi, Raki menemukan Claymore, yang dikenal sebagai Clare, dan memutuskan untuk mengikutinya dalam perjalanannya.
Saat pasangan ini melakukan perjalanan dari kota ke kota, mengalahkan youma di sepanjang jalan, lebih banyak informasi tentang organisasi Clare dan rekan-rekan pejuangnya terungkap. Dengan setiap kota dibersihkan dan setiap iblis dihancurkan, mereka semakin dekat dengan youma tempat Clare ingin membalas dendam sejak dia memilih menjadi Claymore.
