Digimon Tamers mengambil latar dunia di mana waralaba Digimon yang populer sangat populer, yang terdiri dari kartun, video game, dan permainan kartu perdagangan. Takato Matsuda adalah penggemar berat Digimon yang sangat terobsesi dengan permainan kartu ini, dan terus-menerus melamun tentang alam semesta di dalamnya. Suatu hari, ia menemukan kartu biru misterius, yang ia masukkan ke dalam mainan pemindai untuk digunakan dalam permainan pertempuran yang populer itu. Mainannya tiba-tiba bersinar dan berubah menjadi Digivice, dan desain buatan penggemar Takato, Guilmon, muncul di depannya. Karena sangat senang dengan prospek memiliki Digimon di kehidupan nyata, Takato memeluk pasangan barunya, dan petualangannya sebagai Digimon Tamer pun dimulai.
Takato dengan cepat menemukan bahwa menjadi seorang Digimon Tamer tidak hanya menyenangkan dan bermain-main – pada kenyataannya, ini jauh lebih berbahaya daripada permainan kartu yang biasa dia mainkan. Digimon liar mulai bermunculan di seluruh Jepang, menyebabkan amukan yang mengakibatkan kekacauan dan kekacauan. Berbekal Digivice miliknya, yang dapat memindai kartu perdagangan untuk memperkuat Guilmon, Takato dan rekan barunya berangkat untuk memerangi Digimon nakal. Mereka ditugaskan untuk melindungi dunia dari serangan Digimon, sementara sebuah organisasi misterius yang bertekad untuk melenyapkan semua Digimon dan Tamers mereka mengintai di balik bayang-bayang…
