Gintoki, Shinpachi, dan Kagura kembali sebagai anggota tim Yorozuya yang suka bersenang-senang tetapi bangkrut! Hidup di dunia lain Edo, di mana pedang dilarang dan penguasa asing telah menaklukkan Jepang, mereka mencoba untuk bertahan hidup dengan melakukan pekerjaan apa pun yang bisa mereka lakukan. Namun, Shinpachi dan Kagura masih belum dibayar… Apakah Gin-chan benar-benar menghabiskan semua uangnya untuk bermain pachinko?
Sementara itu, ketika Gintoki dalam keadaan mabuk berjalan sempoyongan pulang ke rumah pada suatu malam, sebuah pesawat luar angkasa asing jatuh di dekatnya. Seorang anggota kru yang terluka parah muncul dari kapal dan memberi Gintoki sebuah alat aneh berbentuk jam, memperingatkannya bahwa alat itu sangat kuat dan harus dijaga. Mengira itu adalah jam wekernya, Gintoki kemudian menghancurkan alat tersebut keesokan paginya dan tiba-tiba menemukan bahwa dunia di luar apartemennya terhenti. Dengan Kagura dan Shinpachi di sisinya, dia berangkat untuk memperbaiki perangkat tersebut; meskipun, seperti biasa, tidak ada yang sesederhana itu bagi tim Yorozuya.
Dipenuhi dengan humor yang menggelitik dan momen-momen yang menyentuh hati, musim keempat Gintama menemukan Gintoki dan teman-temannya menghadapi kesialan yang paling lucu sekaligus krisis yang paling berbahaya.
