Monyet supersonik, vampir, ikan berbicara, dan berbagai monster supernatural yang hidup berdampingan dengan manusia—ini telah menjadi bagian dari kehidupan sehari-hari di Hellsalem’s Lot, yang dulu dikenal sebagai Kota New York, selama beberapa waktu sekarang. Ketika sebuah gerbang antara Bumi dan Beyond terbuka tiga tahun lalu, penduduk New York dan makhluk dari dimensi lain sama-sama terjebak dalam gelembung yang tak dapat ditembus dan terpaksa hidup bersama. Libra adalah organisasi rahasia yang terdiri dari orang-orang eksentrik dan superhuman, bertugas menjaga ketertiban di kota dan memastikan bahwa kekacauan tidak menyebar ke seluruh dunia.
Menekuni fotografi sebagai hobi, Leonardo Watch menjalani kehidupan normal bersama orang tua dan saudara perempuannya. Namun, ketika dia mendapatkan “Mata Mengetahui Segalanya dari Dewa” dengan mengorbankan penglihatan saudara perempuannya, dia pergi ke Hellsalem’s Lot untuk membantunya dengan mencari jawaban tentang kekuatan misterius yang dia terima. Tak lama kemudian, dia bertemu dengan Libra, dan ketika Leo secara tak terduga bergabung dengan mereka, dia mendapatkan lebih dari yang dia tawar. Kekkai Sensen mengikuti petualangan Leo yang tidak biasa di tempat paling aneh di Bumi dengan rekan-rekannya yang sama anehnya—sebagai anak biasa yang tanpa sadar melihat kehidupannya berubah menjadi luar biasa.