Dalam sekejap mata, tiga puluh ribu gamer Jepang yang kebingungan dibawa dari kehidupan sehari-hari mereka ke dalam dunia MMORPG populer, Elder Tale, setelah pembaruan terbaru game ini – tidak dapat keluar. Di antara mereka ada seorang mahasiswa yang canggung secara sosial, Shiroe, yang kebingungan dan keterkejutannya hanya berlangsung sesaat karena sebagai seorang veteran dalam game ini, ia segera mulai menjelajahi batas-batas realitas barunya.
Shiroe harus belajar untuk hidup di dunia baru ini, memimpin orang lain dan bernegosiasi dengan “penduduk asli” NPC untuk membawa stabilitas ke kota virtual Akihabara. Dia bergabung dengan temannya yang malang, Naotsugu, yang baru pertama kali masuk ke dunia virtual setelah bertahun-tahun dan mendapati dirinya terperangkap, dan Akatsuki, seorang pembunuh bertubuh mungil namun ganas yang menganggap Shiroe sebagai tuannya. Sebuah kisah fantasi, petualangan, dan politik, Log Horizon mengeksplorasi elemen-elemen game melalui mata seorang ahli strategi yang berusaha memanfaatkan situasi yang membingungkan.