Saikin, Imouto no Yousu ga Chotto Okashiinda ga. mengisahkan tentang sebuah keluarga yang baru saja mulai membangun kembali. Ketika mereka menikah, Tuan dan Nyonya Kanzaki membawa serta seorang putra dan putri remaja. Namun, Mitsuki Kanzaki yang baru masuk SMA kurang begitu senang. Tersengat oleh sejarah figur ayah yang tidak hadir dan kasar, dia lambat menerima ayah tiri dan saudara tirinya.
Namun setelah sebuah kecelakaan membuat Mitsuki dirawat di rumah sakit, ia mendapati dirinya dirasuki oleh hantu Hiyori Kotobuki, seorang gadis seusianya yang jatuh cinta pada saudara tiri Mitsuki, Yuuya. Hiyori tidak dapat meneruskan hadiah terakhirnya karena cintanya yang bertepuk sebelah tangan pada Yuuya, yang berarti dia harus menyempurnakannya… di dalam tubuh Mitsuki?!
Sekarang, hidup Mitsuki tergantung pada membawa Hiyori ke Surga. Tapi apakah dia akan terbiasa berbagi dengan hantu yang suka memaksa dan penuh cinta? Dapatkah dia mengatasi ketidakpercayaannya pada keluarga barunya? Dapatkah dia membawa dirinya untuk memenuhi perasaan Hiyori terhadap Yuuya? Dan mungkinkah dia menyembunyikan perasaannya sendiri?
