Karena muak dengan masyarakat, para pemuda di seluruh Neo-Tokyo membentuk suku-suku untuk menemukan tempat mereka di dunia. Namun, kesetiaan kelompok di antara mereka tumbuh sengit dan sering kali berujung pada kekerasan. Sebagai tindakan pencegahan, pemerintah menerapkan Hukum XB-yang menyatakan bahwa konflik suku harus diselesaikan melalui Baseball Ekstrim. Dari pemain yang menggunakan pemukul yang dapat diperpanjang hingga pelempar bola yang mengenakan peralatan khusus, Extreme Baseball adalah versi futuristik dari olahraga ini dengan peraturan yang dimodifikasi, batasan yang lebih sedikit, dan penerapan teknologi yang aneh.
Ketika sekelompok anak muda menggertak Haru Shirokane yang tidak bertulang, dia diselamatkan oleh pasangan yang tidak terduga: Shun Kamiya dan Taiga. Ternyata, Shun adalah pemain bintang Baseball Ekstrim yang memimpin Suku Minato, tim peringkat teratas di Kota Minato. Sementara itu, Taiga bertujuan untuk mengalahkan Shun dengan harapan menjadi yang terkuat dalam olahraga ini. Dalam serangkaian peristiwa spontan yang memungkinkan Shun untuk menemukan potensi mereka, Taiga dan Haru diikat untuk bergabung dengan Suku Minato.
Ketika suku-suku di seluruh Kota Minato menghadapi ancaman baru yang dipimpin oleh Oujirou Otori yang misterius, Suku Minato mungkin hanya membutuhkan kekuatan dari dua anggota baru mereka untuk mengatasi cengkeraman kejahatan.
