Ueki Kousuke, siswa kelas 1-C di Sekolah Menengah Pertama Hinokuni, diberikan kemampuan oleh gurunya yang sebenarnya adalah salah satu calon Dewa, Kobayashi Sensei (biasa disebut Kobasen) untuk mengubah apa pun yang dia anggap sebagai sampah menjadi pohon. Suatu hari, selama ujian, teman sekelasnya, Mori Ai, secara tidak sengaja menyaksikan kemampuan Ueki dan mulai curiga, berusaha mengungkap identitas sebenarnya Ueki dengan mengikuti dia. Namun, seiring waktu, setelah menyaksikan tindakan Ueki yang penuh pengorbanan demi keadilan, Mori Ai perlahan menjadi pengertiannya.
Ueki yang diberi kemampuan ini, terlibat dalam sebuah pertarungan unik yang diinisiasi oleh Kobayashi Sensei dan 100 calon Dewa lainnya. Pertarungan ini adalah sebuah eksperimen untuk menentukan, melalui siswa SMP, hukum atau aturan apa yang akan mengubah dunia. Pemenang dari pertarungan ini akan diberikan “Bakat Kosong,” sebuah hadiah yang memungkinkan pemenangnya menulis bakat apapun yang mereka inginkan.
Dalam pertarungan fantastis ini, Ueki dengan kemampuannya mengubah sampah menjadi pohon, berhadapan dengan lawan-lawan yang memiliki kemampuan luar biasa seperti mengubah impian menjadi kenyataan, mengubah handuk tangan menjadi besi, dan mengubah manik-manik menjadi bom. Ueki harus menghadapi mereka untuk mencegah “Bakat Kosong” jatuh ke tangan yang salah. Pertanyaannya, dapatkah Ueki menjadi siswa SMP terkuat di dunia?
