Nariyuki Yuiga, seorang siswa kelas 3 SMA yang kurang mampu, bekerja keras untuk mendapatkan nominasi VIP, sebuah beasiswa yang akan menanggung semua biaya kuliahnya. Sebagai penghargaan atas kerja kerasnya, kepala sekolah memberikan beasiswa yang terkenal itu.
Namun, beasiswa ini diberikan dengan satu syarat: dia harus menjadi tutor bagi para siswa jenius di sekolah dalam mata pelajaran yang paling lemah! Bergabunglah dengan kelompok murid-murid barunya, yaitu maestro matematika Rizu Ogata, yang ingin belajar ilmu humaniora; legenda sastra Fumino Furuhashi, yang ingin belajar ilmu pengetahuan; dan teman masa kecil Yuiga yang pintar berolahraga, Uruka Takemoto, yang tidak memiliki harapan dalam hal lain.
Bokutachi wa Benkyou ga Dekinai mengikuti Yuiga saat dia mencoba mengajar tiga muridnya yang eksentrik dalam serangkaian kejenakaan yang aneh dan lucu. Namun, ketika ambisi Ogata dan Furuhashi bertentangan dengan bakat mereka, akankah Yuiga dapat membantu murid-muridnya mencapai impian mereka?
