Dengan lautan yang selalu terancam oleh “Armada Abyssal” yang bermusuhan, sebuah pangkalan angkatan laut khusus didirikan untuk melawan mereka. Namun, alih-alih persenjataan angkatan laut standar, pangkalan ini dipersenjatai dengan “Kanmusu” – gadis-gadis yang menyimpan roh kapal perang Jepang – yang memiliki kemampuan untuk mengenakan perlengkapan bersenjata yang memungkinkan mereka untuk memanfaatkan jiwa yang kuat di dalam diri mereka. Fubuki, seorang Kanmusu tipe Destroyer muda, bergabung dengan pangkalan sebagai anggota baru; sayangnya, meskipun tidak berpengalaman dan pemalu, dia ditugaskan di Skuadron Torpedo Ketiga yang terkenal dan dengan cepat masuk ke dalam panasnya pertempuran. Ketika dia diselamatkan dari kehancuran yang hampir terjadi, kapal perang pemula ini bertekad untuk menjadi sekuat orang yang menyelamatkannya.
Awal pertempuran yang menentukan semakin dekat di Teluk Leyte melawan Armada Abyssal, musuh misterius yang menduduki lautan. Sebagai satu-satunya yang mampu melawan mereka, Kanmusu & mdash; gadis-gadis muda yang memiliki jiwa kapal perang & mdash; mengatur ulang persiapan. Kapal perusak kelas Shiratsuyu, Shigure, ditugaskan di Pasukan Pemukul Pertama, Bagian Ketiga, yang juga dikenal sebagai 1YB3H.
Sayangnya bagi Shigure, 1YB3H terdiri dari beberapa Kanmusu yang tersisa dan berfungsi sebagai armada pengalih perhatian. Karena harus berhadapan langsung dengan Armada Abyssal, ini mungkin akan menjadi misi pertama dan terakhir mereka bersama. Meski begitu, Shigure menolak untuk membiarkan musuh merebut rekannya yang lain. Saat mereka bergerak maju menuju Teluk Leyte dalam misi bunuh diri ini, para anggota 1YB3H harus saling mendukung dan bertekad untuk membuktikan kemampuan mereka sebagai kapal yang kompeten.
