Dalam novel visual, bendera imajiner diartikan sebagai peristiwa yang menjadi titik balik keseluruhan cerita. Seorang pemain yang memicu bendera romansa untuk pahlawan wanita akan melanjutkan rutenya, atau bendera kematian akan menandakan bahwa karakter tertentu akan mati setelahnya.
Siswa SMA Souta Hatate dapat melihat bendera ini di atas kepala seseorang, dan memiliki kemampuan untuk menurunkannya untuk menghentikan terjadinya peristiwa tertentu. Dengan menggunakan kekuatan ini, dia telah mencegah kematian orang lain. Tapi, setelah kecelakaan di masa lalu dan dia adalah satu-satunya yang selamat, dia akhirnya percaya bahwa hanya kemalangan yang akan menimpa orang-orang di dekatnya, dan sejak saat itu dia menahan diri untuk tidak berteman atau menjalin hubungan.
Namun, semuanya mulai berubah setelah pindah ke sekolah baru. Setelah menjatuhkan bendera kematian lainnya, teman sekelasnya Nanami Knight Bladefield menyadari kekuatannya dan mencoba mempelajari lebih lanjut tentang dia, berjanji bahwa dia akan tetap berada di sisinya tidak peduli apa yang mungkin terjadi. Maka dimulailah perjalanan Souta saat dia bertemu teman dan kenalan baru sambil mengungkap misteri kemampuannya—yang mungkin lebih dalam dari yang diperkirakan siapa pun.