Dalam masyarakat futuristik, Jepang telah menerapkan sistem kompleks yang disebut sebagai “Benang Merah Ilmu Pengetahuan” untuk mendorong pernikahan yang sukses dan memerangi angka kelahiran yang semakin rendah. Berdasarkan perhitungan kecocokan, anak muda pada usia 16 tahun ditentukan pasangan pernikahannya oleh pemerintah, dengan konsekuensi yang berat bagi mereka yang tidak mematuhi aturan tersebut. Bagi Yukari Nejima, seorang remaja yang menganggap dirinya biasa-biasa saja dalam segala hal, sistem ini mungkin merupakan kesempatan terbaiknya untuk menjalani kehidupan yang memuaskan.
Namun, didorong oleh kegilaannya pada teman sekelasnya dan orang yang telah lama ditaksirnya, Misaki Takasaki, Yukari menentang sistem tersebut dan menyatakan cintanya. Setelah beberapa keengganan awal, Misaki membalas perasaannya dengan penuh gairah. Sayangnya, sebelum keduanya dapat melanjutkan hubungan mereka, Yukari menerima pemberitahuan pernikahannya. Dia kemudian terlempar ke dalam jaring cinta dan kebohongan yang membingungkan ketika pasangannya yang ditugaskan untuk tidak terlalu bersemangat, Ririna Sanada, menjadi terpesona dengan romansa terlarangnya.
