Tak lama setelah konfrontasi terakhir Ksatria Sihir dengan “Mashin” Putri Emeraude, Hikaru Shidou kembali ke Tokyo Tower. Di sana, ia bertemu teman-temannya Umi Ryuuzaki dan Fuu Hououji untuk pertama kalinya sejak petualangan spontan mereka menyelamatkan Cephiro. Dihantui mimpi buruk tentang alam yang telah ditinggalkannya, Hikaru lega menemukan bahwa teman-temannya juga ingin kembali dan melayani kerajaan yang pernah mereka lindungi dengan setia.
Keinginan Ksatria Sihir terkabul, karena di puncak Tokyo Tower, mereka dibutakan oleh cahaya besar yang sama yang mereka lihat pada hari pertama mereka bertemu. Sekali lagi di punggung ikan terbang, kelompok ini kembali ke Cephiro—dunia yang kini tandus dan hancur. Dengan runtuhnya kekuatan Pilar, monster-monster bebas berkeliaran di tanah sementara tiga negara berusaha untuk mencaplok Cephiro dengan harapan merebut Pilar untuk diri mereka sendiri. Permasalahan semakin rumit dengan munculnya Lady Debonair yang misterius, yang mengklaim dirinya sebagai pewaris sah negara yang jatuh itu.
Kini menghadapi tantangan yang lebih berat dan musuh yang sangat berbeda, ketiga Ksatria Sihir itu berangkat sekali lagi untuk menyelamatkan Cephiro dan membawa perdamaian. Dengan ikatan yang telah mereka bina bersama, trio ini bersatu menghadapi tantangan besar tersebut.
