Dengan keyakinan bahwa dewa Mitama yang mahakuasa akan datang untuk menyelamatkannya, Yukito Urabe berpartisipasi dalam ritual untuk menjadi pemimpin baru kultus ayahnya. Tapi ketika anak laki-laki itu tenggelam saat ritual berlangsung, dia ingin terlahir kembali di dunia tanpa dewa atau agama.
Kebangkitan kembali di dunia yang sama sekali berbeda tanpa spiritualitas. Dia bertemu dengan seorang gadis menyimpang bernama Aruaru, yang memperkenalkan dia ke desanya. Namun, gambaran indahnya tentang masyarakat dunia ini tidak bertahan lama ketika ia menyaksikan bunuh diri kelompok di depan umum dan mengetahui sistem akhir kehidupan di negara tersebut: kapan saja, pemerintah dapat memerintahkan warga negara mana pun untuk mati.
Aruaru dan saudara perempuannya secara paksa dibawa untuk dieksekusi segera setelah itu, mendorong Yukito bergegas menyelamatkan mereka—tetapi tidak berhasil. Di saat putus asa, Yukito mengingat ajaran ayahnya dan berdoa agar Mitama menyelamatkan mereka. Seolah menjawab panggilannya, seorang gadis kecil turun dari langit dan memusnahkan semua orang yang mencelakai Yukito dan teman-temannya. Yang mengejutkan Yukito, gadis itu memperkenalkan dirinya sebagai Mitama.
