Di hari pertamanya masuk sekolah menengah pertama, Eren Yeager berhadapan langsung dengan titan-dan makan siangnya dicuri! Sejak hari itu, dia menyimpan dendam pada para titan karena telah mengambil makanan kesukaannya, burger keju, dan bersumpah untuk membasmi mereka untuk selamanya. Bersama dengan adik angkatnya Mikasa Ackerman dan teman mereka Armin Arlert, ketiganya menjelajahi lorong-lorong SMP Titan, bertemu dengan wajah-wajah yang tidak asing lagi dan berpartisipasi dalam berbagai kegiatan ekstrakurikuler sebagai bagian dari Klub Pembersihan Tembok.
Sebuah parodi dari serial yang sangat populer, Shingeki! Kyojin Chuugakkou menempatkan karakter-karakter yang dicintai sebagai siswa sekolah menengah pertama, berjuang untuk melindungi makan siang mereka dari para raksasa yang rakus.
